De flesta av de uppenbara anatomiska homologierna är mellan anatomiska strukturer som används aktivt av arten i fråga, men vissa anatomiska homologier involverar strukturer som inte längre behövs men som inte heller försvunnit helt. Ett växtorgan eller struktur är ett organ eller struktur som finns i en art som inte används som i andra arter. I motsats till vad som är vanligt, är vestigiala organ och vestigiala strukturer inte nödvändigtvis värdelösa eller funktionslösa.
Vestigial betyder inte värdelös eller icke-funktionell eftersom det är svårt om inte omöjligt att bevisa att någon speciell struktur är funktionslös. Det är möjligt att vissa vestigialorgan är funktionslösa, men forskare och biologer antar inte så dogmatiskt. Allt som krävs för att ett organ eller struktur ska betecknas "vestigial" är att det finns homologier i andra arter där användningen eller funktionen är tydlig, men samma användning eller funktion är inte fallet för den aktuella arten. Användningen kan vara udda, eller så kan den helt enkelt inte identifieras ännu.
En val av ett bäckenben
Ett exempel på en sådan struktur är valarna av valar. Alla tetrapods (inklusive valar) har bäckenben. Hos de flesta djur behövs bäckenbenen för att kunna flytta den nedre eller bakre uppsättningen av lemmar för rörelse. I vissa arter, som valar, finns dessa extremiteter inte till största delen även om rester av dem kan vara kvar.
Trots denna brist på något behov av dem har valar fortfarande bäckenben. De är ganska små jämfört med sina motsvarigheter i andra djur, men de finns. De kanske tjänar en del funktioner som att hjälpa till att stödja valens reproduktiva anatomi, men det finns många olika typer av strukturer som skulle vara bättre lämpade för en sådan uppgift.
Frågan är, varför skulle en val, som saknar lägre ben och inte behöver bäckenben för att röra sig, ha bäckenben som är homologa för varelser som behöver bäckenben för att röra sig? Liknande homologier finns för ormar och benfria ödlor. Återigen är den enda förklaringen som är meningsfull om dessa varelser utvecklats från en gemensam förfader tillsammans med alla andra tetrapods.
Mänsklig bilaga
Ett annat vanligt (och ofta missförstått) exempel är bilagan. Hos människor har bilagan liten uppenbar funktion, även om det nu verkar som om det kan lagra vissa immunceller. Emellertid har det analoga organet i många andra arter en uppenbar funktion. Dessutom kan den mänskliga bilagan vara positivt nackdel i den meningen att den utsätts för otäcka infektioner som kan vara dödliga.
Bilagan är ett växtorgan eftersom det inte tjänar en funktion som de homologa organen i andra djur även om det kan tjäna en funktion hos människor. Så frågan blir, varför har människor en bilaga? (Eller varför fungerar inte den mänskliga bilagan som det homologa organet i andra djur?) Evolutionen, idén att vi alla har gemensamma förfäder, ger ett meningsfullt svar. Kreationism inte.